Es necesario renombrarlo antecediendo la diagonal inversa "\" al abrir y cerrar los paréntesis.
Es decir, de la manera:
Listando los folders a renombrar
$ ls -1
'disk (1)'/
'disk (1) ( ext01 )'/
'disk(2)'/
'(disk 3)'/
Renombrando y listando primer folder,
$ mv disk\ \(1\) disk_1
$ ls -1
disk_1/
Renombrando y listando segundo folder,
$ mv disk\ \(1\)\ \(\ ext01\ \)/ disk_1_ext01
$ ls -1
disk_1/
disk_1_ext01/
Renombrando y listando tercer folder,
$ mv disk\(2\)/ disk_2
$ ls -1
disk_1/
disk_1_ext01/
disk_2/
Renombrando y listando cuarto folder,
$ mv \(disk\ 3\)/ disk_3
$ ls -1
disk_1/
disk_1_ext01/
disk_2/
disk_3/
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